TaxId1	Genome1	TaxId2	Genome2	nTot1	nTot2	nBoth	nOne	nNeither	nAdj	nSameB	nSameO	nSameN	nSameA	nConvB	nConvO	nConvN	nConvA	nDivB	nDivO	nDivN	nDivA
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	100226	Streptomyces coelicolor A3(2)	1112	7512	74	298	740	38	61	208	537	38	8	42	103	0	5	48	100	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	103690	Nostoc sp. PCC 7120	1112	5366	99	348	665	32	81	247	478	32	14	42	97	0	4	59	90	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	107806	Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum)	1112	564	68	260	784	38	56	190	560	38	8	30	115	0	4	40	109	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	111955	Sulfolobus tokodaii	1112	2826	12	136	964	4	11	100	695	4	1	18	134	0	0	18	135	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	1148	Synechocystis sp. PCC 6803	1112	3167	107	316	689	32	88	215	503	32	12	46	95	0	7	55	91	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	115713	Chlamydophila pneumoniae CWL029	1112	1054	928	172	12	926	683	115	8	681	133	18	2	133	112	39	2	112
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	119072	Thermoanaerobacter tengcongensis	1112	2588	115	326	671	57	96	225	485	57	13	42	98	0	6	59	88	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	122586	Neisseria meningitidis MC58	1112	2079	119	340	653	43	102	231	473	42	8	54	91	1	9	55	89	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	122587	Neisseria meningitidis Z2491	1112	2065	118	340	654	43	102	229	475	42	7	56	90	1	9	55	89	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	1299	Deinococcus radiodurans	1112	2997	82	316	714	35	71	220	515	35	5	48	100	0	6	48	99	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	1360	Lactococcus lactis subsp. lactis	1112	2267	112	308	692	41	89	211	506	41	13	41	99	0	10	56	87	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	13773	Pyrobaculum aerophilum	1112	2605	12	134	966	6	12	99	695	6	0	16	137	0	0	19	134	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	138677	Chlamydophila pneumoniae J138	1112	1069	926	174	12	926	677	120	9	677	135	17	1	135	114	37	2	114
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	1423	Bacillus subtilis	1112	4112	158	344	610	63	120	240	446	63	20	47	86	0	18	57	78	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	1488	Clostridium acetobutylicum	1112	3672	117	338	657	52	95	241	470	52	12	41	100	0	10	56	87	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	1502	Clostridium perfringens	1112	2660	110	336	666	48	89	236	481	48	12	46	95	0	9	54	90	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	155864	Escherichia coli O157:H7 EDL933	1112	5324	135	380	597	48	109	263	434	48	13	57	83	0	13	60	80	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	158878	Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50	1112	2714	121	320	671	51	98	225	483	51	13	41	99	0	10	54	89	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	158879	Staphylococcus aureus subsp. aureus N315	1112	2594	124	320	668	54	100	225	481	54	14	41	98	0	10	54	89	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	160	Treponema pallidum	1112	1036	64	266	782	30	55	195	556	30	5	31	117	0	4	40	109	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	160488	Pseudomonas putida KT2440	1112	5350	122	368	622	47	101	251	454	47	11	55	87	0	10	62	81	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	160490	Streptococcus pyogenes M1 GAS	1112	1697	89	292	731	40	74	215	517	40	9	31	113	0	6	46	101	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	160492	Xylella fastidiosa 9a5c	1112	2766	104	316	692	50	90	215	501	49	7	52	94	0	7	49	97	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	1642	Listeria innocua	1112	2968	126	326	660	46	96	229	481	46	17	44	92	0	13	53	87	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	169963	Listeria monocytogenes EGD-e	1112	2846	126	320	666	45	97	223	486	45	17	42	94	0	12	55	86	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	170187	Streptococcus pneumoniae TIGR4	1112	2094	99	300	713	38	79	212	515	38	12	35	106	0	8	53	92	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	171101	Streptococcus pneumoniae R6	1112	2043	95	302	715	37	78	212	516	37	9	37	107	0	8	53	92	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	176280	Staphylococcus epidermidis ATCC 12228	1112	2419	130	326	656	54	105	223	478	54	15	44	94	0	10	59	84	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	1769	Mycobacterium leprae	1112	1605	62	258	792	29	51	184	571	29	6	36	111	0	5	38	110	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	180835	Agrobacterium tumefaciens str. C58 (U. Washington)	1112	4661	112	364	636	51	92	257	457	50	12	53	88	0	8	54	91	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	181661	Agrobacterium tumefaciens str. C58 (Cereon)	1112	4554	103	360	649	42	82	257	467	41	12	52	89	0	9	51	93	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	182710	Oceanobacillus iheyensis	1112	3500	131	370	611	52	102	258	446	52	14	56	83	0	15	56	82	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	183190	Xylella fastidiosa Temecula1	1112	2034	106	332	674	50	92	227	487	49	7	52	94	0	7	53	93	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	186103	Streptococcus pyogenes MGAS8232	1112	1845	90	292	730	39	74	217	515	39	10	28	115	0	6	47	100	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	186497	Pyrococcus furiosus DSM 3638	1112	2065	15	156	941	6	12	118	676	6	0	21	132	0	3	17	133	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	187410	Yersinia pestis KIM	1112	4090	133	368	611	47	107	258	441	47	14	53	86	0	12	57	84	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	187420	Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H	1112	1873	14	144	954	7	13	108	685	7	0	21	132	0	1	15	137	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	188937	Methanosarcina acetivorans C2A	1112	4540	25	178	909	8	20	123	663	8	3	29	121	0	2	26	125	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	189518	Leptospira interrogans serovar lai str. 56601	1112	4727	102	332	678	43	90	228	488	43	7	48	98	0	5	56	92	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	190192	Methanopyrus kandleri AV19	1112	1687	5	108	999	1	5	80	721	1	0	15	138	0	0	13	140	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	190304	Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586	1112	2067	95	324	693	43	82	231	493	43	7	40	106	0	6	53	94	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	190485	Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913	1112	4181	109	332	671	51	90	231	485	50	8	50	95	0	11	51	91	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	190486	Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306	1112	4312	112	346	654	51	91	242	473	50	8	55	90	0	13	49	91	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	190650	Caulobacter crescentus CB15	1112	3737	99	342	671	40	83	242	481	40	8	51	94	0	8	49	96	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	192952	Methanosarcina mazei Goe1	1112	3371	26	162	924	9	23	116	667	9	1	24	128	0	2	22	129	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	193567	Streptococcus pyogenes SSI-1	1112	1861	80	296	736	34	67	218	521	34	9	30	114	0	4	48	101	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	194439	Chlorobium tepidum TLS	1112	2252	129	318	665	47	107	221	478	47	12	46	95	0	10	51	92	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	196164	Corynebacterium efficiens YS-314	1112	2950	65	300	747	26	51	207	548	26	7	46	100	0	7	47	99	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	196620	Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2	1112	2632	123	322	667	54	99	225	482	54	14	43	96	0	10	54	89	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	196627	Corynebacterium glutamicum ATCC 13032	1112	2993	81	294	737	34	66	201	539	34	7	42	104	0	8	51	94	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	197	Campylobacter jejuni	1112	1634	106	304	702	31	87	211	508	31	10	41	102	0	9	52	92	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	197221	Thermosynechococcus elongatus BP-1	1112	2475	93	318	701	32	78	225	503	32	10	42	101	0	5	51	97	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	198094	Bacillus anthracis str. Ames	1112	5311	147	364	601	62	117	247	442	62	18	54	81	0	12	63	78	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	198214	Shigella flexneri 2a str. 301	1112	4180	127	370	615	44	104	254	448	44	11	57	85	0	12	59	82	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	198215	Shigella flexneri 2a str. 2457T	1112	4068	130	372	610	46	105	255	446	46	12	57	84	0	13	60	80	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	198466	Streptococcus pyogenes MGAS315	1112	1865	89	290	733	38	73	213	520	38	10	29	114	0	6	48	99	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	198804	Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)	1112	545	66	252	794	36	54	185	567	36	8	29	116	0	4	38	111	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	199310	Escherichia coli CFT073	1112	5379	132	372	608	46	109	254	443	46	11	59	83	0	12	59	82	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	203267	Tropheryma whipplei str. Twist	1112	808	63	234	815	34	55	163	588	34	4	31	118	0	4	40	109	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	204722	Brucella suis 1330	1112	3264	107	340	665	52	92	233	481	51	9	52	92	0	6	55	92	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	206672	Bifidobacterium longum NCC2705	1112	1729	65	246	801	35	55	170	581	34	5	35	113	1	5	41	107	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	208435	Streptococcus agalactiae 2603V/R	1112	2124	116	312	684	45	92	220	494	45	14	38	101	0	10	54	89	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	208964	Pseudomonas aeruginosa PAO1	1112	5567	132	360	620	55	110	241	455	54	12	58	83	0	10	61	82	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	209261	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi Ty2	1112	4323	133	382	597	49	107	265	434	49	12	58	83	0	14	59	80	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	2097	Mycoplasma genitalium	1112	484	38	186	888	22	32	133	641	22	4	23	126	0	2	30	121	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	210007	Streptococcus mutans UA159	1112	1960	95	306	711	34	80	210	516	34	9	40	104	0	6	56	91	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	2104	Mycoplasma pneumoniae	1112	689	34	176	902	19	29	121	656	19	3	24	126	0	2	31	120	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	2107	Mycoplasma pulmonis	1112	782	34	180	898	20	30	129	647	20	2	23	128	0	2	28	123	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	211110	Streptococcus agalactiae NEM316	1112	2094	116	306	690	46	92	216	498	46	14	37	102	0	10	53	90	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	211586	Shewanella oneidensis MR-1	1112	4324	133	360	619	56	110	252	444	56	12	50	91	0	11	58	84	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	212717	Clostridium tetani E88	1112	2373	101	338	673	43	79	241	486	43	12	43	98	0	10	54	89	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	2130	Ureaplasma urealyticum	1112	614	35	178	899	21	29	127	650	21	4	22	127	0	2	29	122	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	214092	Yersinia pestis CO92	1112	3885	145	370	597	55	120	256	430	55	13	55	85	0	12	59	82	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	216895	Vibrio vulnificus CMCP6	1112	4537	130	374	608	52	110	251	445	52	11	65	77	0	9	58	86	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	218496	Tropheryma whipplei TW08/27	1112	783	68	238	806	40	59	163	584	40	4	34	115	0	5	41	107	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	2190	Methanocaldococcus jannaschii	1112	1729	8	140	964	3	8	103	695	3	0	18	135	0	0	19	134	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	220668	Lactobacillus plantarum WCFS1	1112	3009	109	314	689	43	85	221	500	43	15	38	100	0	9	55	89	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	223283	Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000	1112	5471	125	354	633	49	106	235	465	48	9	55	89	0	10	64	79	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	2234	Archaeoglobus fulgidus	1112	2420	15	160	937	6	14	119	673	6	0	23	130	0	1	18	134	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	223926	Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633	1112	4832	135	376	601	51	110	257	439	51	12	61	80	0	13	58	82	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	224326	Borrelia burgdorferi B31	1112	851	56	248	808	27	50	178	578	27	3	34	116	0	3	36	114	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	224915	Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae)	1112	504	71	248	793	43	62	175	569	43	4	33	116	0	5	40	108	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	226185	Enterococcus faecalis V583	1112	3113	111	306	695	46	91	213	502	46	12	39	102	0	8	54	91	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	226186	Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482	1112	4778	108	336	668	36	87	232	487	36	13	50	90	0	8	54	91	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	226900	Bacillus cereus ATCC 14579	1112	5234	139	358	615	57	108	243	455	57	18	53	82	0	13	62	78	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	227377	Coxiella burnetii RSA 493	1112	2009	118	324	670	56	102	217	487	56	6	53	94	0	10	54	89	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	227882	Streptomyces avermitilis MA-4680	1112	7575	75	308	729	36	64	210	532	36	8	43	102	0	3	55	95	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	227941	Chlamydophila caviae GPIC	1112	998	677	254	181	673	505	147	154	502	92	50	11	91	80	57	16	80
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	228410	Nitrosomonas europaea ATCC 19718	1112	2461	117	338	657	56	101	230	475	56	8	55	90	0	8	53	92	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	2287	Sulfolobus solfataricus	1112	2977	13	140	959	6	11	100	695	6	1	20	132	0	1	20	132	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	2303	Thermoplasma acidophilum	1112	1482	7	166	939	5	6	117	683	5	0	26	127	0	1	23	129	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	233150	Mycoplasma gallisepticum R	1112	726	40	184	888	24	35	129	642	24	3	24	126	0	2	31	120	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	2336	Thermotoga maritima	1112	1858	78	306	728	33	64	218	524	33	8	42	103	0	6	46	101	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	28227	Mycoplasma penetrans	1112	1037	34	204	874	18	29	141	636	18	3	28	122	0	2	35	116	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	28232	Geobacter metallireducens	1112	3237	110	342	660	51	90	235	481	50	11	50	92	0	9	57	87	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	29292	Pyrococcus abyssi	1112	1769	16	146	950	5	13	107	686	5	0	21	132	0	3	18	132	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	29459	Brucella melitensis	1112	3198	105	326	681	49	87	227	492	48	11	49	93	0	7	50	96	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	305	Ralstonia solanacearum	1112	3440	113	352	647	47	94	242	470	47	6	58	89	0	13	52	88	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	36870	Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis	1112	654	66	282	764	30	56	203	547	30	4	39	110	0	6	40	107	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	375	Bradyrhizobium japonicum	1112	8317	108	366	638	45	90	256	460	44	8	56	89	0	10	54	89	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	381	Mesorhizobium loti	1112	6746	122	340	650	54	102	233	471	53	10	53	90	0	10	54	89	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	382	Sinorhizobium meliloti	1112	3341	110	358	644	45	93	245	468	44	9	56	88	0	8	57	88	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	50339	Thermoplasma volcanium	1112	1499	11	170	931	5	10	121	675	5	0	26	127	0	1	23	129	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	53953	Pyrococcus horikoshii	1112	1801	15	136	961	4	12	101	693	4	0	18	135	0	3	17	133	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	56636	Aeropyrum pernix	1112	1840	11	126	975	6	10	92	704	5	0	17	136	0	1	17	135	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	63363	Aquifex aeolicus	1112	1529	107	314	691	29	92	214	500	29	10	46	97	0	5	54	94	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	64091	Halobacterium sp. NRC-1	1112	2075	15	146	951	6	15	104	687	6	0	20	133	0	0	22	131	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	666	Vibrio cholerae	1112	3835	140	360	612	55	113	247	446	54	13	59	81	0	14	54	85	1
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	71421	Haemophilus influenzae Rd KW20	1112	1714	120	358	634	43	102	244	460	43	7	58	88	0	11	56	86	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	747	Pasteurella multocida	1112	2015	122	364	626	43	100	251	455	43	11	53	89	0	11	60	82	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	781	Rickettsia conorii	1112	1374	87	314	711	36	81	205	520	36	3	51	99	0	3	58	92	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	782	Rickettsia prowazekii	1112	835	85	312	715	36	79	200	527	36	3	54	96	0	3	58	92	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	813	Chlamydia trachomatis	1112	895	619	284	209	592	461	170	175	452	83	53	17	73	75	61	17	67
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	83331	Mycobacterium tuberculosis CDC1551	1112	4187	66	268	778	28	54	193	559	28	6	38	109	0	6	37	110	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	83332	Mycobacterium tuberculosis H37Rv	1112	3927	66	272	774	27	54	196	556	27	6	38	109	0	6	38	109	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	83333	Escherichia coli K12	1112	4279	136	378	598	48	110	262	434	48	13	56	84	0	13	60	80	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	83334	Escherichia coli O157:H7	1112	5361	135	380	597	48	109	263	434	48	13	57	83	0	13	60	80	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	83560	Chlamydia muridarum	1112	904	609	292	211	581	457	173	176	444	80	56	17	72	72	63	18	65
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	84588	Synechococcus sp. WH 8102	1112	2089	78	304	730	32	66	219	521	32	8	38	107	0	4	47	102	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	85962	Helicobacter pylori 26695	1112	1576	95	306	711	30	80	209	517	30	8	47	98	0	7	50	96	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	85963	Helicobacter pylori J99	1112	1491	91	314	707	31	77	217	512	31	9	46	98	0	5	51	97	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	86665	Bacillus halodurans	1112	4066	143	366	603	62	110	250	446	62	16	58	79	0	17	58	78	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	881	Desulfovibrio vulgaris	1112	3674	113	326	673	58	95	225	486	58	10	49	94	0	8	52	93	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	90370	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi	1112	4395	132	380	600	49	107	263	436	49	12	57	84	0	13	60	80	0
115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	99287	Salmonella typhimurium LT2	1112	4451	131	382	599	47	105	266	435	47	12	58	83	0	14	58	81	0