TaxId1	Genome1	TaxId2	Genome2	nTot1	nTot2	nBoth	nOne	nNeither	nAdj	nSameB	nSameO	nSameN	nSameA	nConvB	nConvO	nConvN	nConvA	nDivB	nDivO	nDivN	nDivA
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	100226	Streptomyces coelicolor A3(2)	783	7512	233	330	220	129	193	250	154	117	22	38	33	6	18	42	33	6
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	103690	Nostoc sp. PCC 7120	783	5366	147	308	328	37	122	234	241	37	8	45	40	0	17	29	47	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	107806	Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum)	783	564	75	222	486	40	71	166	360	40	1	30	62	0	3	26	64	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	111955	Sulfolobus tokodaii	783	2826	25	168	590	9	17	120	460	6	1	26	66	0	7	22	64	3
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	1148	Synechocystis sp. PCC 6803	783	3167	133	304	346	34	111	230	256	34	8	41	44	0	14	33	46	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	115711	Chlamydophila pneumoniae AR39	783	1112	70	234	479	35	65	181	351	35	1	28	64	0	4	25	64	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	115713	Chlamydophila pneumoniae CWL029	783	1054	70	236	477	35	65	182	350	35	1	28	64	0	4	26	63	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	119072	Thermoanaerobacter tengcongensis	783	2588	136	312	335	77	118	237	242	75	7	40	46	1	11	35	47	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	122586	Neisseria meningitidis MC58	783	2079	125	282	376	50	113	206	278	49	4	37	52	0	8	39	46	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	122587	Neisseria meningitidis Z2491	783	2065	128	282	373	50	114	212	271	50	5	35	53	0	9	35	49	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	1299	Deinococcus radiodurans	783	2997	118	300	365	41	106	220	271	40	2	44	47	1	10	36	47	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	1360	Lactococcus lactis subsp. lactis	783	2267	122	312	349	50	110	228	259	49	3	47	43	0	9	37	47	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	13773	Pyrobaculum aerophilum	783	2605	23	170	590	11	20	127	450	10	0	23	70	0	3	20	70	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	138677	Chlamydophila pneumoniae J138	783	1069	70	234	479	35	65	182	350	35	1	27	65	0	4	25	64	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	1423	Bacillus subtilis	783	4112	166	336	281	77	146	243	208	75	7	51	35	0	13	42	38	2
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	1488	Clostridium acetobutylicum	783	3672	141	304	338	74	126	232	239	71	7	33	53	1	8	39	46	2
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	1502	Clostridium perfringens	783	2660	131	288	364	65	115	222	260	63	7	35	51	1	9	31	53	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	155864	Escherichia coli O157:H7 EDL933	783	5324	147	316	320	59	128	239	230	59	8	40	45	0	11	37	45	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	158878	Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50	783	2714	148	320	315	70	134	236	227	69	3	50	40	0	11	34	48	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	158879	Staphylococcus aureus subsp. aureus N315	783	2594	148	320	315	69	134	237	226	68	3	50	40	0	11	33	49	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	160	Treponema pallidum	783	1036	58	230	495	32	56	180	361	32	1	23	69	0	1	27	65	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	160488	Pseudomonas putida KT2440	783	5350	142	306	335	54	124	227	246	53	6	42	45	0	12	37	44	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	160490	Streptococcus pyogenes M1 GAS	783	1697	113	274	396	46	102	207	288	45	3	34	56	0	8	33	52	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	160492	Xylella fastidiosa 9a5c	783	2766	122	288	373	48	101	223	273	47	5	36	52	0	16	29	48	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	1642	Listeria innocua	783	2968	158	306	319	73	137	227	233	71	7	45	41	0	14	34	45	2
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	169963	Listeria monocytogenes EGD-e	783	2846	156	302	325	73	133	226	238	70	7	44	42	0	16	32	45	3
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	170187	Streptococcus pneumoniae TIGR4	783	2094	125	300	358	51	111	234	252	50	4	37	52	0	10	29	54	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	171101	Streptococcus pneumoniae R6	783	2043	128	300	355	56	113	236	248	54	4	36	53	0	11	28	54	2
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	176280	Staphylococcus epidermidis ATCC 12228	783	2419	138	316	329	67	127	234	236	66	3	49	41	0	8	33	52	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	1769	Mycobacterium leprae	783	1605	201	322	260	108	165	247	185	100	15	40	38	2	21	35	37	6
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	180835	Agrobacterium tumefaciens str. C58 (U. Washington)	783	4661	139	314	330	56	120	232	245	54	7	43	43	1	12	39	42	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	181661	Agrobacterium tumefaciens str. C58 (Cereon)	783	4554	126	312	345	50	108	234	255	48	7	41	45	1	11	37	45	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	182710	Oceanobacillus iheyensis	783	3500	174	314	295	88	156	226	215	86	6	48	39	0	12	40	41	2
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	183190	Xylella fastidiosa Temecula1	783	2034	125	286	372	54	108	216	273	53	5	35	53	0	12	35	46	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	186103	Streptococcus pyogenes MGAS8232	783	1845	113	278	392	46	102	210	285	45	3	34	56	0	8	34	51	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	186497	Pyrococcus furiosus DSM 3638	783	2065	32	190	561	12	24	135	438	12	4	25	64	0	4	30	59	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	187410	Yersinia pestis KIM	783	4090	132	326	325	50	113	248	236	50	8	37	48	0	11	41	41	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	187420	Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H	783	1873	23	172	588	10	21	127	449	10	0	24	69	0	2	21	70	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	188937	Methanosarcina acetivorans C2A	783	4540	39	198	546	14	35	143	419	13	0	31	62	0	4	24	65	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	189518	Leptospira interrogans serovar lai str. 56601	783	4727	121	300	362	49	104	223	270	47	7	38	48	1	10	39	44	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	190192	Methanopyrus kandleri AV19	783	1687	17	146	620	2	14	108	475	2	1	20	72	0	2	18	73	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	190304	Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586	783	2067	114	290	379	48	101	226	270	45	4	34	55	2	9	30	54	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	190485	Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913	783	4181	126	310	347	45	105	233	259	44	5	43	45	0	16	34	43	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	190486	Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306	783	4312	126	312	345	46	104	234	259	45	5	45	43	0	17	33	43	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	190650	Caulobacter crescentus CB15	783	3737	113	306	364	39	95	238	264	38	8	32	53	0	10	36	47	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	192952	Methanosarcina mazei Goe1	783	3371	31	184	568	13	27	135	435	12	1	28	64	0	3	21	69	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	193567	Streptococcus pyogenes SSI-1	783	1861	108	278	397	42	97	213	287	41	2	33	58	0	9	32	52	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	194439	Chlorobium tepidum TLS	783	2252	123	276	384	47	109	213	275	46	5	34	54	0	9	29	55	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	196164	Corynebacterium efficiens YS-314	783	2950	219	338	226	121	176	255	166	113	20	42	31	3	23	41	29	5
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	196620	Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2	783	2632	152	316	315	72	138	234	225	71	3	50	40	0	11	32	50	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	196627	Corynebacterium glutamicum ATCC 13032	783	2993	247	340	196	129	197	256	144	118	22	45	26	4	28	39	26	7
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	197	Campylobacter jejuni	783	1634	99	288	396	25	88	222	287	25	4	37	52	0	7	29	57	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	197221	Thermosynechococcus elongatus BP-1	783	2475	121	310	352	27	100	238	259	26	6	42	45	0	15	30	48	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	198094	Bacillus anthracis str. Ames	783	5311	163	326	294	79	141	244	212	76	7	47	39	0	15	35	43	3
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	198214	Shigella flexneri 2a str. 301	783	4180	137	308	338	58	120	231	246	58	5	43	45	0	12	34	47	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	198215	Shigella flexneri 2a str. 2457T	783	4068	145	310	328	61	126	234	237	61	8	39	46	0	11	37	45	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	198466	Streptococcus pyogenes MGAS315	783	1865	114	282	387	45	102	215	280	44	3	34	56	0	9	33	51	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	198804	Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)	783	545	62	224	497	30	57	173	367	30	2	27	64	0	3	24	66	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	199310	Escherichia coli CFT073	783	5379	143	318	322	58	126	239	232	58	6	41	46	0	11	38	44	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	203267	Tropheryma whipplei str. Twist	783	808	669	100	14	663	515	72	10	513	76	15	2	75	78	13	2	75
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	204722	Brucella suis 1330	783	3264	136	304	343	51	116	229	252	51	6	42	45	0	14	33	46	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	206672	Bifidobacterium longum NCC2705	783	1729	165	336	282	95	144	245	208	91	7	48	38	0	14	43	36	4
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	208435	Streptococcus agalactiae 2603V/R	783	2124	122	304	357	52	112	232	253	51	2	39	52	0	8	33	52	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	208964	Pseudomonas aeruginosa PAO1	783	5567	153	300	330	63	131	223	243	62	7	41	45	0	15	36	42	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	209261	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi Ty2	783	4323	152	302	329	58	132	227	238	58	8	39	46	0	12	36	45	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	2097	Mycoplasma genitalium	783	484	40	164	579	28	38	127	432	28	0	18	75	0	2	19	72	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	210007	Streptococcus mutans UA159	783	1960	120	290	373	45	107	227	263	45	3	33	57	0	10	30	53	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	2104	Mycoplasma pneumoniae	783	689	44	152	587	29	42	118	437	29	0	17	76	0	2	17	74	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	2107	Mycoplasma pulmonis	783	782	42	162	579	29	41	136	420	29	0	11	82	0	1	15	77	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	211110	Streptococcus agalactiae NEM316	783	2094	122	300	361	51	110	230	257	50	3	38	52	0	9	32	52	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	211586	Shewanella oneidensis MR-1	783	4324	143	284	356	58	122	214	261	57	7	39	47	0	14	31	48	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	212717	Clostridium tetani E88	783	2373	102	314	367	56	90	233	274	54	6	42	45	1	6	39	48	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	2130	Ureaplasma urealyticum	783	614	43	164	576	31	41	135	421	31	0	15	78	0	2	14	77	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	214092	Yersinia pestis CO92	783	3885	144	328	311	55	124	250	223	55	8	37	48	0	12	41	40	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	216895	Vibrio vulnificus CMCP6	783	4537	124	296	363	48	111	220	266	48	3	42	48	0	10	34	49	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	2190	Methanocaldococcus jannaschii	783	1729	21	160	602	3	16	116	465	3	2	24	67	0	3	20	70	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	220668	Lactobacillus plantarum WCFS1	783	3009	131	304	348	64	117	225	255	62	3	48	42	0	11	31	51	2
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	223283	Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000	783	5471	145	312	326	51	126	234	237	51	6	43	44	0	13	35	45	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	2234	Archaeoglobus fulgidus	783	2420	26	174	583	6	20	123	454	6	1	27	65	0	5	24	64	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	223926	Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633	783	4832	146	296	341	48	121	222	254	48	8	45	40	0	17	29	47	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	224326	Borrelia burgdorferi B31	783	851	51	212	520	27	49	167	381	27	1	19	73	0	1	26	66	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	224915	Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae)	783	504	74	196	513	42	72	148	377	42	1	21	71	0	1	27	65	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	226185	Enterococcus faecalis V583	783	3113	124	306	353	62	110	230	257	60	4	42	47	0	10	34	49	2
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	226186	Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482	783	4778	129	292	362	38	112	218	267	38	7	35	51	0	10	39	44	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	226900	Bacillus cereus ATCC 14579	783	5234	156	328	299	72	136	247	214	69	8	43	42	0	12	38	43	3
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	227377	Coxiella burnetii RSA 493	783	2009	123	280	380	54	108	210	279	54	2	39	52	0	13	31	49	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	227882	Streptomyces avermitilis MA-4680	783	7575	258	318	207	141	213	237	147	127	20	42	31	7	25	39	29	7
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	227941	Chlamydophila caviae GPIC	783	998	68	236	479	28	63	187	347	28	1	24	68	0	4	25	64	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	228410	Nitrosomonas europaea ATCC 19718	783	2461	137	276	370	56	118	212	267	56	6	33	54	0	13	31	49	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	2287	Sulfolobus solfataricus	783	2977	25	184	574	10	17	131	449	9	1	29	63	0	7	24	62	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	2303	Thermoplasma acidophilum	783	1482	26	176	581	6	21	125	451	6	0	27	66	0	5	24	64	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	233150	Mycoplasma gallisepticum R	783	726	39	182	562	27	37	145	415	27	1	15	77	0	1	22	70	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	2336	Thermotoga maritima	783	1858	111	284	388	48	97	219	281	47	6	32	55	0	8	33	52	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	28227	Mycoplasma penetrans	783	1037	37	204	542	19	33	166	398	19	1	20	72	0	3	18	72	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	28232	Geobacter metallireducens	783	3237	102	310	371	42	86	232	279	42	7	39	47	0	9	39	45	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	29292	Pyrococcus abyssi	783	1769	28	176	579	12	22	124	451	11	1	29	63	0	5	23	65	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	29459	Brucella melitensis	783	3198	126	304	353	47	106	228	263	47	7	41	45	0	13	35	45	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	305	Ralstonia solanacearum	783	3440	140	304	339	63	123	226	248	62	4	43	46	0	13	35	45	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	36870	Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis	783	654	62	250	471	24	53	195	349	24	3	30	60	0	6	25	62	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	375	Bradyrhizobium japonicum	783	8317	130	304	349	53	110	233	254	52	7	41	45	1	13	30	50	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	381	Mesorhizobium loti	783	6746	131	314	338	53	114	231	252	52	6	43	44	0	11	40	42	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	382	Sinorhizobium meliloti	783	3341	138	318	327	56	119	234	244	55	6	47	40	0	13	37	43	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	50339	Thermoplasma volcanium	783	1499	30	178	575	8	25	124	448	7	0	27	66	0	5	27	61	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	53953	Pyrococcus horikoshii	783	1801	24	176	583	7	16	126	455	6	2	29	62	0	6	21	66	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	56636	Aeropyrum pernix	783	1840	18	150	615	8	14	107	476	7	1	22	70	0	3	21	69	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	63363	Aquifex aeolicus	783	1529	97	286	400	18	86	217	294	18	3	36	54	0	8	33	52	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	64091	Halobacterium sp. NRC-1	783	2075	34	200	549	9	27	153	417	9	2	26	65	0	5	21	67	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	666	Vibrio cholerae	783	3835	132	294	357	51	116	218	263	51	7	40	46	0	9	36	48	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	71421	Haemophilus influenzae Rd KW20	783	1714	119	296	368	46	104	225	268	46	7	33	53	0	8	38	47	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	747	Pasteurella multocida	783	2015	125	306	352	51	108	237	252	51	6	35	52	0	11	34	48	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	781	Rickettsia conorii	783	1374	77	232	474	35	71	181	345	35	2	21	70	0	4	30	59	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	782	Rickettsia prowazekii	783	835	75	230	478	37	70	180	347	37	1	22	70	0	4	28	61	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	813	Chlamydia trachomatis	783	895	66	236	481	31	62	185	350	31	1	25	67	0	3	26	64	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	83331	Mycobacterium tuberculosis CDC1551	783	4187	229	328	226	117	188	249	160	109	20	42	31	2	21	37	35	6
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	83332	Mycobacterium tuberculosis H37Rv	783	3927	231	328	224	118	188	249	160	109	20	43	30	2	23	36	34	7
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	83333	Escherichia coli K12	783	4279	151	314	318	60	131	236	230	60	8	41	44	0	12	37	44	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	83334	Escherichia coli O157:H7	783	5361	145	318	320	59	126	240	231	59	8	41	44	0	11	37	45	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	83560	Chlamydia muridarum	783	904	72	232	479	33	68	180	349	33	1	27	65	0	3	25	65	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	84588	Synechococcus sp. WH 8102	783	2089	110	278	395	32	95	215	287	31	4	34	55	0	11	29	53	1
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	85962	Helicobacter pylori 26695	783	1576	89	268	426	27	80	203	314	27	4	34	55	0	5	31	57	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	85963	Helicobacter pylori J99	783	1491	86	266	431	24	77	203	317	24	4	33	56	0	5	30	58	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	86665	Bacillus halodurans	783	4066	152	322	309	77	133	243	221	75	5	45	43	0	14	34	45	2
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	881	Desulfovibrio vulgaris	783	3674	107	298	378	46	94	230	273	46	6	33	54	0	7	35	51	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	90370	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi	783	4395	153	300	330	57	131	227	239	57	9	38	46	0	13	35	45	0
218496	Tropheryma whipplei TW08/27	99287	Salmonella typhimurium LT2	783	4451	149	306	328	59	131	228	238	59	8	40	45	0	10	38	45	0